O Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal (PPGBA) iniciou suas atividades de implantação no primeiro semestre de 2011. A sua primeira turma, denominada de Turma 2011, ingressou e começou suas atividades em agosto desse mesmo ano. A partir da demanda de profissionais graduados nos cursos de Ciências Biológicas e áreas afins, mas sem capacitação qualificada nas diferentes áreas relacionadas à biologia animal, verificou-se o grande potencial para implementar o PPGBA a fim de oferecer o mestrado acadêmico e assim suprir essa lacuna na região do Mato Grosso do Sul (MS) e estados limítrofes para atuar no mercado de trabalho na área da academia e pesquisa. Adicionalmente, um grupo de professores atuantes em diferentes áreas das Ciências Biológicas da UFMS envolvendo organismos animais, mas que até então apresentavam escassa integração entre si e/ou com pouca expressão e inserção na pós-graduação (por falta enquadramento nas suas linhas de pesquisa), ansiavam por alavancar o desenvolvimento de estudos integrados que compreendesse áreas correlatas à zoologia, além de incrementar sua inclusão e participação na formação de recurso humano nessa área.

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